Vorig seizoen kwam Mike van der Hoorn voor vier miljoen over van FC Utrecht. Hij werd gehaald als vervanger van Toby Alderweireld, die een stapje hogerop ging bij Atletico Madrid. Van der Hoorn werd echter gepasseerd in de revue door Joël Veltman, die naast Niklas Moisander in het hart van de defensie kwam te staan. Ook Stefano Denswil kreeg bij afwezigheid van één van het centrale duo de voorkeur boven Van der Hoorn. Uiteindelijk kwam de inmiddels 21-jarige speler tot drie wedstrijden.
Door afwezigheid van Joël Veltman aan het begin van dit seizoen mocht Van der Hoorn wel tweemaal spelen. Ditmaal kreeg hij dus wel de voorkeur boven Denswil. Ook maakte Van der Hoorn uit bij Groningen nog negen minuten als pinchhitter, waar hij verrassend de voorkeur kreeg boven spits Arkadiusz Milik. De verdediger wilt echter niet wéér een heel seizoen wissel zitten. “Ik kan niet eeuwig blijven wachten. Het is duidelijk: vorig jaar heb ik niet veel gespeeld, dat moet dit jaar anders. Lukt dat niet, dan is vertrekken zeker een optie. Je moet eerlijk zijn tegen jezelf.” Ajax nieuws
Op 5 juli 2013 werd bekend gemaakt dat Van der Hoorn een transfer maakt naar AFC Ajax. Op 11 juli 2013 tekende Van der Hoorn een contract voor 4 jaar bij Ajax. Twee dagen later maakte hij zijn officieuze debuut in een oefenwedstrijd tegen RKC Waalwijk (1-5 winst), hij verving Toby Alderweireld na de rust. Op 17 augustus 2013 maakte van der Hoorn zijn officiële debuut voor de hoofdmacht van Ajax in de thuiswedstrijd tegen Feyenoord, die met 2-1 werd gewonnen, verving hij in de 88e minuut Ruben Ligeon.
Op 26 augustus 2013 speelde van der Hoorn voor het eerst in het seizoen 2013/14 mee met Jong Ajax in de Jupiler League wedstrijd tegen FC Emmen (1-1).
Op 18 september 2013 maakte van der Hoorn zijn Europese debuut in de UEFA Champions League wedstrijd uit tegen FC Barcelona die met 4-0 werd verloren verving van der Hoorn in de 73e minuut Niklas Moisander. Op 1 oktober 2013 mocht Van der Hoorn weer invallen voor Niklas Moisander tegen AC Milan. Naar het oordeel van de scheidsrechter zou Van der Hoorn een overtreding hebben begaan op Mario Balotelli, waarna laatstgenoemde de penalty tijdens de blessuretijd in het doel van AFC Ajax wist te schoppen. Hierdoor kwam de eindstand op 1-1 te staan.
Op 10 augustus 2014 scoorde van der Hoorn zijn eerste officiële doelpunt in dienst van Ajax in de Eredivisie thuiswedstrijd tegen Vitesse die met 4-1 werd gewonnen. Ajax nieuws Ajax1.nl